Деградация нуклеиновых кислот происходит при различных функциональных процессах путем гидролиза
фосфодиэфирных связи в реакции, катализируемой специальными ферментами? нуклеазами.
Нуклеазы разделяют на разные типы по определенным признакам:
• РНКазы и ДНКазы являются специфическими соответствующим нуклеиновых кислот.
• Екзонуклеазы отщепляют нуклеотиды один за одним из концов цепи, соответственно различают 5'-и 3'-екзонуклеазы. Эндонуклеазы гидролизуют фосфодиэфирных связь внутри цепи.
• Среди эндонуклеаз, которые имеют своим субстратом двухцепную молекулу ДНК есть такие, которые делают одноцепочечный разрез? ник (nick), оставляя другой цепь интактным. Другие осуществляют дволанцюгови разрезы.
• Среди эндонуклеаз являются неспецифические по последовательности нуклеотидов. Но есть также большая группа бактериальных ферментов рестриктаз? которые действуют только на определенные небольшие (чаще четыре или шесть нуклеотидов) элементы последовательности. Рестриктазы выполняют в бактериальной клетке роль защиты от чужеродной ДНК бактериофагов и широко используются как инструменты исследования в молекулярной биологии (см. раздел 11).
Реакция гидролиза фосфодиэфирных связи является энергетически выгодной. Из этого следует, что нуклеотид (нуклеозидмонофосфат) не может быть использован для синтеза нуклеиновых кислот? зато к реакциям синтеза привлекаются соответствующие нуклеозидтрифосфаты.