Этим термином обозначают процесс восстановления повреждённой ДНК ферментами репарационных систем бактериальной клетки.
В качестве примера рассмотрим экспериментальные модели фотореактивации (как пример репарации, осуществляемой одним ферментом) и систему темновой репарации (как пример репарации, осуществляемой последовательной активацией группы ферментов).
А. Репарация путем фотореактивации осуществляется следующим образом.
1. Бактериальная культура облучается ультрафиолетом, (в качестве мутагена).
2. Ультрафиолет вызывает в геноме бактериальной культуры образование тиминовых димеров (т.е. появляется индуцированная мутация).
3. Затем культура освещается видимым светом.
4. Видимый свет вызывает активация специального репарационного фермента.
5. Активированный репарационный фермент одномоментно расщепляет тиминовые димеры, ликвидирую тем самым мутацию.
Б. Система темновой репарации работает следующим образом.
1. Бактериальная культура облучается ультрафиолетом, в результате чего в ее геноме (рассмотрим для простоты случай с появлением мутации только в одной нити ДНК) появляется мутация – на определенном участке формируются тиминовые димеры.
2. Мутантная культура помещается в темноту для активации ферментов темновой репарации. Первой активируется эндонуклеаза, которая надрезает с обеих сторон мутантный участок.
3. Затем ДНК-полимераза I удаляет поврежденный участок.
4. Вслед за этим на матрице второй, неповрежденной, нити ДНК синтезируется новый, не содержащий мутации, участок (с помощью ДНК-полимеразы I или III).
5. И, наконец, лигаза «вшивает» новый участок в цепь ДНК.