После распада СССР Киргизия оказалась в кризисном состоянии, так как имела большую долю обрабатывающих отраслей, значительно интегрированных в общесоюзную экономику.
Распад СССР лишил страну субсидий из союзного бюджета. И в то же время процент снижения ВВП по сравнению с 1989 г. составил в ней 47% при среднем по СНГ в 53%.
В начальный период суверенитета руководство страны приступило к проведению политики, направленной на создание и развитие рыночной инфраструктуры, ускорение преобразования форм собственности на основе разгосударствления и приватизации. Много внимания уделяли активизации деятельности малых и средних предприятий, для чего разрабатывали соответствующее законодательство. Почти сразу с обучением независимости исчез госзаказ, появилась свободная конкурентная торговля. Страна одной из первых на постсоветском пространстве ввела собственную валюту (май 1993 г.). Была проведена аграрная реформа, наделившая крестьян землей. Сейчас в Киргизии создают основы рынка земли.
Либеральное законодательство и стабильность режима позволили привлечь значительное количество частных и государственных иностранных инвестиций для создания высокотехнологичных отраслей. Но ситуация продолжала ухудшаться до 1995 г. В 1996—1997 гг. наступили стабилизация и некоторое оживление экономики. Последовавший в 1998 г. мировой финансовый кризис сильно сказался на хозяйстве страны. Пришлось девальвировать до этого довольно стабильную национальную валюту. Снизились темпы роста ВВП. Поэтому в 2000 г. увеличение ВВП составило только 5%, тогда как в 1996—1997 гг. оно достигало 7—10%. Увеличение было связано в основном с восстановлением производства на предприятиях легкой промышленности.