Климат Эстонии морской, влажный, формирующийся под воздействием морских воздушных масс Атлантического океана.
Средняя температура воздуха самого холодного месяца от -3,4 °С на западе до -6,б °С на востоке (Тарту).
В июле температура воздуха по всей Эстонии достигает 16—17 °С. Осадки выпадают круглый год, в распределении их по территории наблюдаются различия. Максимальное количество выпадает на возвышенностях — до 700 мм. На побережье максимум осадков бывает осенью. Одна из типичных черт морского климата — медленный переход одного времени года в другое. Весна обычно запаздывает.
Летом погода довольно устойчива. Осень — самое продолжительное время года. Зима теплая, мягкая. Теплые морские ветры, дующие с Атлантического океана и Балтийского моря, вызывают зимой оттепели. Снежный покров держится от 70 до 130 дней в году, мощность снежного покрова не превышает 35 см. Обилие осадков и повышенная влажность воздуха способствуют заболачиванию многих районов.