V-и J-гены имеют два типа сигналов распознавания
: гептаметр (7 пар нуклеотидов) и наномер (9 пар нуклеотидов). В V-гене между ними находятся 11-12 пар нуклеотидов, а в J-гене - 21-23 пары. Поэтому говорят, что механизм рекомбинации подчиняется правилу 12/23. Сайты кроссовера сближаются с помощью фермента рекомбиназа, которая узнает сигналы гептамеру и наномеру на обоих генах, подлежащих рекомбинации. Рекомбиназа кодируется двумя генами, RAG1 и RAG2. Именно начало экспрессии этих генов является сигналом для того, чтобы в клетке началась перестройка генов иммуноглобулинов. Рекомбинция запускает транскрипцию перестроенного цепи прекращает рекомбинацию других вариантов соответствующего гена и, таким образом, определяет клональный характер лимфоцитов каждая клетка продуцирует антитела только одной специфичности.
Важно отметить, что гипервариабильни участки V-доменов (CDRs) кодируются:
- На легком цепи: 1,2 - на V-гене, 3 - на соединении VJ;
- На тяжелом цепи: 1,2 - на V-гене, 3 - D-сегменте.
Таким образом, в строении активного центра антител принимают участие продукты V-, D-и J-генов.