Так как жизнь на Земле основана на соединениях углерода, этот элемент является основным для по-строения и успешного функционирования бактериальной клетки.
А. Бактерии, использующие в качестве источника углерода неорганические соединения (углекислый газ, карбонаты), называются аутотрофами. Аутотрофы не вызывают патологических процессов в организме человека и не являются предметом изучения медицинской микробиологии.
Б. Медицинская микробиология имеет дело с бактериями, которые в качестве источника углерода используют органические соединения. Такие бактерии называются гетеротрофами.
1. Те гетеротрофы, которые могут использовать в качестве источника углерода так называемую «мер-вую органику» (например, раствор глюкозы), называются сапрофитами. Те гетеротрофы, которые используют в качестве источника углерода органические соединения (метаболиты) живой клетки, называются паразитами.
а. Подавляющее большинство бактерий этой группы могут использовать в качестве источника углерода как «мертвую», так и «живую» органику. Такие бактерии называются факультативными паразитами. Их можно культивировать на искусственных питательных средах, основанных на растворах органических соединений.
б. Риккетсии и хламидии не могут использовать в качестве источника углерода «мертвую» органику. Они могут размножаться только внутри живой клетки, используя ее органические вещества для своих метаболических процессов. Их называют облигатными паразитами. Как и вирусы, эти бактерии не растут на искусственных питательных средах.