В нескольких особых случаях процесс созревания мРНК включает также различные модификации
, которые объединяют под названием редактирования мРНК (mRNA editing). Изменение, которое чаще всего происходит во время сплайсинга или сразу после него, не является типичным эукариотических процессом, хотя и встречается практически во всех таксонах.
В митохондриях простых большинство мРНК подвергается редактированию по РНК-зависимым механизмом. Так называемая гиду РНК (guide RNA) спаривается с комплементарной участком мРНК и инициирует сбор мультибилковои едитосомы (editosome), компоненты которой обеспечивают удаление или инсерции уридина в определенное место участки мРНК. В митохондриях и хлоропластах растений часто происходит дезаминирование цитидина с заменой его на уридин, что меняет кодирующие свойства многих мРНК.
Дезаминирования аденина в определенном месте цепи с превращением его в инозин (неканоническая пуриновых оснований, см. Раздел 8) происходит в мРНК различных субъединиц Glu-зависимого Са2 +-канала нервных клеток млекопитающих. Следствием нуклеотидной замены является аминокислотные замены в составе белка (внутри трансмембранные поры) комбинация различных (редактируемых и не редактируемых) субъединиц создает разнообразие каналов по их чувствительности к химическому сигналу (аминокислоты Glu) и скорости потока Са2 + через мембрану. Изменение такого типа по-лежит от активности специальных ферментов (аденозин деаминазы). Считается, что они связываются с двухцепная шпильками, временно формируются в мРНК во время синтеза, где узнают определенные элементы последовательности пар оснований.
Другим примером является преобразование путем дезаминирования определенного цитидина на уридин в мРНК аполипобилка В (ApoB, apolipoprotein B) печени млекопитающих. Замена вызывает превращение глутаминового кодона на стоп-кодон. В результате белок может существовать в двух формах с различной длиной полипептидной цепи. Обе формы используются для транспорта триглицеридов и холестерина через кровь, причем длинная форма связана с повышением риска атеросклероза. Редактирование мРНК ApoB, которое происходит параллельно с полиаденилуванням, зависит от определенной последовательности мРНК, которая узнается комплексом белков, среди которых? специфическая деаминазы.