Экологическая микробиология является не только разделом микробиологии, но и соответствующим разделом экологии и, следовательно, оперирует терминами этой науки.
Поэтому, прежде всего, следует определиться с основными из них и, конечно, дать определение самому понятию «экологическая микробиология».
А. Экологическая микробиология – раздел общей микробиологии, изучающий взаимоотношения микроорганизмов между собой, с объектами внешней среды и макроорганизмом.
Б. Популяция – совокупность особей одного вида, обитающих в пределах определенного биотопа.
В. Биотоп – территориально ограниченный участок биосферы с относительно однородными условия-ми жизни.
Г. Микробиоценоз – сообщество популяций микроорганизмов, обитающих в определенном биотопе.
Д. Экосистема – система, состоящая из биотопа и микробиоценоза.
Е. Онтосфера – совокупность паразитарных экосистем (т.е. таких, в которых микробиоценоз представлен микробом-паразитом).
Ж. Биосфера – общая сумма всех экосистем (живая оболочка планеты).