Биосферный резерват Сиан-Каан расположен на восточном побережье полуострова Юкатан. На языке индейцев майя, в давние времена населяли этот район, Сиан-Каан означает «там, где начинается небо».
Огромный полуостров, площадь которого вдвое превышает территорию Португалии, разделена между тремя странами: северная, большая часть, принадлежит Мексике, а на юге располагаются земли Белиза и Гватемалы. Эти края были колыбелью великой цивилизации майя, уничтоженной испанцами четыре века назад, и сохранили до наших дней немало памятников уникальной культуры аборигенов Америки. Этому в немалой степени способствовали своеобразные природные условия Юкатана, не привлекали испанских колонизаторов.
Территория большей части полуострова - это низменная равнина, лишь немного приподнята над уровнем моря. Южные и восточные ветры, дующие со стороны моря, приносят сюда обильные дожди, поэтому, казалось бы, густые джунгли должны покрывать Юкатан подобно Индокитая. Однако на самом деле картина не такая идеальная. Растительность влажных центральной и южной областей полуострова представлена преимущественно тропическими лесами, а на севере полуострова Юкатан преобладают редколесья и ксерофитные кусты. Их заросли индейцы называют чапаралем. На территории резервата являются лесные массивы, мангры и болота, а также значительная участок морской акватории. Местная флора и фауна отличаются достаточно разнообразием. Среди животных представлены несколько видов кошачьих хищников, в том числе оцелот, ягуарунди и дикая полосатая кошка, чорнорука паукообразные обезьяны и другие редкие виды. Оцелоты живут поодиночке и охотятся преимущественно ночью. Во время дневной жары любят прятаться в дуплах деревьев. Несмотря на великолепное умение залезать на деревья и камни, охотятся на земле. К добыче оцелот относятся преимущественно небольшие млекопитающие и птицы. Из-за интенсивного истребления сегодня оцелот стал крайне редким животным. Ягуарунди - скрытны животные, также ведут преимущественно одинокий образ жизни. В отличие от большинства кошачьих, они активны в основном днем. Ягуарунди - наземные животные, однако умеют хорошо лазить по деревьям и плавать. Впрочем, на деревья они выкарабкивающихся только в случае крайней необходимости.
В водах у побережья живет карибский ламантин. Он питается преимущественно травяной донной растительностью. Средняя длина взрослого ламантина составляет около 3 м, хотя некоторые особи могут достигать 4,5 м вместе с хвостом. Вес этих животных варьирует в среднем в пределах 200-600 кг, самые экземпляры достигают 1,5 т. Эти животные довольно спокойно сосуществуют с человеком, неплохо переносят неволю. Иногда их специально переселяют в отдельные реки и каналы для их очистки от чрезмерной растительности.
В резервате обитает более 300 видов птиц. Флора насчитывает около 1200 видов.
Как и на всей территории Юкатана, на территории Сиан-Каан много карстовых пещер и колодцев. Колодцы-сеноты образуются там, где кровля известнякового слоя обрушилась в подземную полость, расположенную близко к поверхности. Такие колодцы достигают 30-40 м в поперечнике и служат резервуарами воды. Еще во времена империи майя эти источники жизни обожествлялись индейцами. В раскопанной археологами древней столице майя Чичен-Ице сих пор существует глубокая сенот диаметром около 50 м с расположенным на двадцатиметровой глубине озером, куда майя торжественно бросали дары богу дождя.
Вдоль берегов полуострова простирается коралловый барьерный риф. Он входит в состав Месоамериканського Барьерного рифа, простирающегося на 900 км от северной оконечности Юкатана до берегов Гватемалы. Эта рифовая система является крупнейшей в Атлантическом океане и вторая по величине в мире после австралийского Большого барьерного рифа.