В экономике Молдавии внешняя торговля играет важную роль, что связано с двумя факторами — большой зависимостью страны от импорта многих видов ресурсов, особенно энергоносителей, а также узостью внутреннего рынка и необходимостью пополнения валютных запасов за счет продажи более половины производимых товаров.
Внешнеторговые связи Молдавии в советские времена были ориентированы главным образом на республики Союза. В экспорте их доля составляла 97%, а в импорте — 87%. В настоящее время происходит диверсификация связей.
В 2000 г. на СНГ приходилось 58% экспорта и только 34% импорта. Среди стран СНГ основным торговым партнером Молдавии остается Россия, ни долю которой приходится 76% ее экспорта в эти страны и 45,9% импорта из них. Экспортные поставки состоят преимущественно из сельскохозяйственной продукции и изделий ее переработки, доля которых в экспорте с каждым годом возрастает. В 2000 г. она составила 55,5%. Экспорт, его размеры в значительной степени зависят от урожая и от спроса в России на молдавскую винодельческую продукцию. В настоящее время Молдавия не в состоянии хотя бы частично заменить в экспорте сельскохозяйственную продукцию на любую другую. В структуре импорта преобладают энергоносители, современное оборудование, ядохимикаты и удобрения для сельского хозяйства, текстиль для швейных и трикотажных предприятий. Кризисное состояние экономики вносит некоторые изменения в структуру импорта. Они состоят в увеличению импорта потребительских товаров, прежде всего текстиля и текстильных изделий, которые вытесняют отечественную продукцию. Наряду с этим сокращаются поставки в Молдавию химической продукции, особенно минеральных удобрений, пластмасс, бумаги и др.
Молдавия поддерживает торговые связи более чем со 100 странами. Нa долю се основных торговых партнеров приходится около 90% внешнеторгового оборота страны. Как уже отмечено, главным торговым партнером остается Россия.
Несмотря на стабильность внешнеторговых отношений между двумя странами, могут возникать проблемы. Так, в 1999 г. было отмечено резкое сокращение товарооборота с Россией. Экспорт сократился почти на 70%, импорт — на 44%. Впервые за всю историю торговых отношений Молдавии с Россией было зарегистрировано отрицательное сальдо торговли в размере 13 млн долл. (в 1998 г. оно было положительным и составляло 121,5 млн долл.). Столь резкое сокращение товарооборота между двумя странами было вызвано как последствиями российского финансового кризиса, так и мерами российского Правительства по ограничению импорта алкогольной продукции и сахара. Федеральный закон «О повышении акцизов на импорт алкоголя», принятый в 1998 г., о также постановление Правительства РФ «О временных мерах по защите российского свеклосахарного комплекса», установившее специальную пошлину в размере 20% от таможенной стоимости ввозимого в страну сахара, фактически блокировали поставки этой продукции из Молдавии, что резко ухудшило ее внешнеторговые показатели. Позднее, правда, были подписаны долгосрочная программа экономического сотрудничества между двумя странами на период 1999—2008 гг. и протокол о беспошлинной поставке в Россию в 1999 г. 32 тыс. т молдавского сахара.
Невысокое качество молдавских товаров затрудняет их сбыт на рынках многих стран. Так, несмотря на подписанное между Молдавией и Румынией соглашение о свободной торговле, его не удалось выполнить из-за жестких санитарных, ветеринарных и технических требований к молдавским товарам со стороны Румынии.
С целью активизации экспортной политики в стране с 2000 г. начала работать молдавская организация «МЕРО», финансирование которой осуществляет Евросоюз. Для сотрудничества с торговыми партнерами программой выделено несколько отраслей, к которым относятся виноделие, переработка овощей и фруктов, производство изделий легкой промышленности, я также машиностроение, в частности электроника.